Le mode de gouvernance du Centre de la francophonie des Amériques est unique et innovant. Son conseil d’administration est composé de 15 membres. Quatre personnes sont nommées par le gouvernement du Québec, quatre sont désignées par des ministres du Québec et sept sont élues par les membres du Centre et issues des communautés francophones des Amériques.
Personnes nommées par le gouvernement du Québec

Michel Robitaille
Président du conseil d’administration

Sylvain Lavoie
Président-directeur général

Monique C. Cormier
Personne provenant du Québec

Peggy Feehan
Personne provenant de l’extérieur du Canada (Louisiane, États-Unis)
Personnes désignées par des ministres du gouvernement du Québec

Éric Bergeron
Personne désignée par le ministre de la Culture et des Communications

Marie-Claude Francoeur
Personne désignée par la ministre des Relations internationales et de la Francophonie

Geneviève Lajoie
Personne désignée par le ministre de la Langue française

Éric Marquis
Personne désignée par le ministre responsable des Relations canadiennes
Personnes élues

Soukaina Boutiyeb
Personne élue parmi les dirigeant(e)s des organismes pancanadiens des communautés francophones et acadiennes du Canada

Padminee Chundunsing
Personne élue provenant de l’Ouest ou des territoires (Canada)

Vladimir Destinvil
Personne élue provenant de l’extérieur du Canada

Flavia Garcia
Personne élue provenant du Québec

Jeanne-d’Arc Gaudet
Personne élue provenant de l’Acadie

Josée Poirier-Crête
Personne élue provenant de l’Ontario

Marguerite Tölgyesi
Personne élue âgée de 35 ans et moins lors de son élection (Yukon)
Personnes ayant occupé la présidence du conseil d’administration
• Jean-Louis Roy (2008-2013)
• Claire Simard, par intérim (2013-2015)
• Diane Blais (2015-2018)
• Clément Duhaime (2018-2019)
• Michel Robitaille (2019-)
Personne ayant occupé la présidence-direction générale
• Michel Robitaille (2008-2010)
• Denis Desgagnés (2010-2019)
• Johanne Whittom (2019-2020)
• Sylvain Lavoie (2020-)